在公安机关已掌握犯罪事实的情况下投案，仍然有可能算主动投案。以下是对此问题的详细分析：

一. 主动投案的定义

主动投案，是指犯罪嫌疑人在犯罪事实或者其本人未被司法机关发觉，或者虽然被发觉，但尚未受到讯问、未被采取强制措施时，主动、直接向司法机关投案的行为。这是自首成立的条件之一。

二. 公安机关掌握犯罪事实与主动投案的关系

1. 是否掌握犯罪事实不影响主动投案的认定：根据最高人民法院《关于处理自首和立功具体应用法律若干问题的解释》第一条第（一）项的规定，自动投案并不以公安机关是否掌握犯罪事实为前提。只要犯罪嫌疑人在尚未受到讯问、未被采取强制措施时主动投案，即可视为自动投案。

2. 投案行为的主动性和自愿性：即使公安机关已经掌握犯罪事实，但犯罪嫌疑人仍然具有选择是否投案的自由。如果其能主动投案，并如实供述自己的罪行，就表明其具有投案的主动性和自愿性，这符合自首的立法本意。

三. 司法实践中的案例支持

• 在最高人民法院公布的刑事指导案例第354号——王春明盗窃案中，认定犯罪嫌疑人被公安机关口头或电话传唤后直接到案，并如实供述自己的罪行的，应当认定为自首。
• 在《人民法院报》2011年1月13日第7版中收录的崔清玉等人故意伤害案中，也认定犯罪嫌疑人接到公安机关电话传唤到案，因电话传唤并非强制措施，又能如实供述犯罪事实的，应依法认定为自首。

四. 特殊情况下的分析

如果公安机关已经对犯罪嫌疑人采取了强制措施，如拘传、取保候审、监视居住、拘留、逮捕等，那么此时再投案就不能再认定为自动投案了。因为此时犯罪嫌疑人已经失去了投案的主动性和自愿性。

总结：

在公安机关已掌握犯罪事实的情况下，如果犯罪嫌疑人尚未受到讯问、未被采取强制措施，且能主动投案并如实供述自己的罪行，那么其行为仍然有可能被认定为自动投案。这是符合自首的立法本意和司法实践经验的。

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