事业单位工作人员旷工半天，单位可以依据内部规章制度扣除相应工资。具体分析如下：

一. 单位内部规章制度的规定

• 事业单位通常会有内部的考勤制度和员工手册，对旷工行为进行明确的规定。这些规定一般会包括旷工的定义、旷工的处理方式以及旷工期间的工资扣除等。
• 根据这些规章制度，单位有权对旷工半天的员工扣除相应的工资，作为对旷工行为的直接经济惩罚。

二. 法律法规的支撑

• 虽然《劳动法》等法律法规未直接规定事业单位旷工半天的具体工资扣除方式，但它们强调了用人单位应建立健全的规章制度来规范员工行为，并确保处理措施符合法律法规的要求。
• 因此，事业单位在处理旷工问题时，应确保处理措施（包括工资扣除）符合内部规章制度的要求，且不侵犯员工的合法权益。

三. 工资扣除的具体操作

• 单位在扣除旷工半天工资时，应明确告知员工扣除的原因、依据以及具体金额，确保透明公正。
• 扣除的工资一般按照旷工日数计算，即日工资数乘以旷工天数（半天按0.5天计算）。

我建议：事业单位应建立健全的考勤制度和规章制度，明确旷工行为的定义和处理方式，确保在处理旷工问题时能够有据可依，同时保障员工的合法权益。员工也应充分了解并遵守单位的规章制度，避免旷工行为的发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。