不可以。代付工程款不能认定为支付工程款结清，这涉及到多个法律关系和财务处理细节。

一. 工程款支付与结算的法律关系

根据《中华人民共和国民法典》第八百零七条，发包人未按照约定支付价款的，承包人有权催告发包人在合理期限内支付价款。这表明，工程款的支付和结算必须遵循合同约定和法律规定，不能仅凭代付行为就认定工程款已经结清。

二. 代付工程款的法律性质

1. 代付行为的定义：代付工程款是指一方委托另一方代为支付款项给第三方的行为，这通常涉及三方主体：委托方、代付方及收款方。代付方在收到委托方的支付指令后，按照指令将款项支付给指定的收款方。
2. 资金流动的性质：在代付过程中，资金的所有权并未发生转移，代付方仅是作为支付的通道或工具。这与工程款的直接支付和结算存在本质区别。

三. 工程款结清的法律要件

工程款结清通常需要满足以下要件：

1. 双方确认：发包人和承包人之间需要就工程款的支付和结算达成一致意见，并签署相关结算文件。
2. 财务处理：在会计上，工程款结清需要进行相应的账务处理，如借记应付工程款科目，贷记银行存款等科目。
3. 合同义务履行完毕：根据合同约定，发包人已经履行了全部支付义务，且承包人对此无异议。

四. 代付工程款不能认定为支付工程款结清的原因

1. 缺乏双方确认：仅凭代付行为，并不能证明发包人和承包人之间就工程款的支付和结算达成了一致意见。
2. 财务处理不完整：代付工程款可能并未在发包人和承包人的财务账面上进行完整的账务处理，因此不能作为工程款结清的依据。
3. 合同义务未明确履行：代付工程款可能并未涵盖合同约定的全部工程款支付义务，因此不能证明发包人已经履行了全部支付义务。

我的观点：代付工程款不能认定为支付工程款结清。工程款结清需要满足一系列法律要件和财务处理要求，仅凭代付行为是无法达到这一标准的。如有进一步需要，您可以继续咨询我。