保密费是用人单位与劳动者基于保密协议或劳动合同中的保密条款而约定的经济补偿，其合法性及具体约定需遵循相关法律法规。

一. 保密费的性质与法律依据

1. 保密费的性质：保密费是用人单位为保护其商业秘密和知识产权，对负有保密义务的劳动者支付的一种经济补偿。它体现了用人单位对劳动者履行保密义务的期待与回报。
2. 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十三条，用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项，并对负有保密义务的劳动者，在劳动合同或者保密协议中约定竞业限制条款，同时约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。

二. 保密费的约定与支付

1. 约定方式：保密费的具体数额、支付方式及时间等，应由用人单位与劳动者在劳动合同或保密协议中明确约定。这有助于双方明确权利与义务，避免后续纠纷。
2. 支付方式：保密费可以定期支付，也可以一次性支付，具体方式由双方协商确定。但需要注意的是，将保密费包含在工资中的约定是不合法的，因为这可能被视为用工担保的一种形式，违反了法律规定。

三. 保密费的法律效力与违约责任

1. 法律效力：保密费作为劳动合同或保密协议的一部分，一旦双方签字盖章，即具有法律效力。用人单位应按时支付保密费，否则可能构成违约。
2. 违约责任：若用人单位未按时支付保密费，劳动者有权依据劳动合同或保密协议追究其违约责任，包括要求支付违约金或解除竞业限制约定等。

四. 实际应用中的建议

1. 明确约定：在签订劳动合同或保密协议时，双方应明确约定保密费的具体数额、支付方式、时间以及违约责任等，以确保双方权益得到保障。
2. 合法合规：用人单位应遵守相关法律法规，不得将保密费包含在工资中，也不得以其他名义向劳动者收取财物。
3. 合理激励：用人单位应通过合理的薪酬结构和激励机制，鼓励劳动者自觉遵守保密义务，保护企业的商业秘密和核心竞争力。

我建议：在签订涉及保密费的劳动合同或保密协议时，双方应充分沟通并明确相关条款，确保约定合法、合规且有效。同时，用人单位应加强对劳动者的保密培训和教育，提高其保密意识和能力。如有进一步需要，您可以继续咨询我。