协议只有单方和作为证明人的第三人签字，且双方都说不认识第三人，该协议通常无效。以下是对此结论的详细分析：

1. 合同成立的基本要素：

   • 合同是双方意思表示一致的产物，需要双方当事人就合同的主要条款达成合意。
   • 在大多数情况下，合同的成立需要双方当事人的签字或盖章，以证明双方对合同内容的认可和接受。

2. 第三方证明人的角色：

   • 第三方证明人通常用于证明合同的存在和双方当事人的身份，以及合同签署的真实性。
   • 然而，如果双方当事人都不认识这个第三方证明人，那么该证明人的存在就无法起到证明合同真实性和双方合意的作用。

3. 协议的有效性分析：

   • 在只有单方和第三方证明人签字的情况下，如果双方都表示不认识这个第三人，那么很难认定这是双方真实意思表示的产物。
   • 这种情况下，协议很可能因为缺乏双方当事人的合意而被认定为无效。

4. 法律后果：

   • 如果协议被认定为无效，那么双方基于该协议所产生的权利和义务也将不复存在。
   • 任何一方都不能依据该协议向对方主张权利或要求履行义务。

综上所述，协议只有单方和作为证明人的第三人签字，且双方都说不认识第三人时，该协议通常无效。如果你有其他关于合同纠纷的问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。