村上整改排水沟本身并不直接构成违法行为，但具体是否违法取决于整改过程是否遵循了相关法律法规。以下是对此问题的详细分析：
一. 整改排水沟的合法性依据
土地使用权与所有权：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》，农村和城市郊区的土地，除由法律规定属于国家所有的以外，属于农民集体所有。因此，排水沟若位于农村集体土地上，其整改需考虑土地所有权和使用权的相关法律规定。
水资源保护与利用：
- 《中华人民共和国水法》鼓励单位和个人依法开发、利用水资源，并保护其合法权益。整改排水沟时，应确保水资源的合法利用和保护，不得损害他人的合法权益。
二. 整改排水沟的潜在违法情形
未经批准擅自整改：
- 如果村上未经相关部门批准，擅自对排水沟进行整改，可能构成违法行为。特别是当整改行为影响到其他村民的灌溉、排水等合法权益时，将需要承担相应的法律责任。
破坏排水功能或引发环境问题：
- 排水沟作为农村重要的排水设施，其整改不得破坏其原有的排水功能。若整改导致排水不畅或引发环境问题，如防洪能力下降、水质污染等，将可能构成违法行为。
三. 合法整改排水沟的建议
申请并获得批准：
- 在进行排水沟整改前，应向相关部门（如村委会、乡镇政府等）提出申请，并获得批准。确保整改行为符合土地利用总体规划和村庄规划等要求。
尊重相邻关系：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不动产权利人应当为相邻权利人用水、排水提供必要的便利。因此，在整改排水沟时，应充分考虑相邻土地权利人的权益，避免对其造成损害。
确保整改质量与安全：
- 整改排水沟时，应确保工程质量符合相关标准，同时采取措施保障施工安全，防止因施工不当引发的安全事故或环境问题。
我的观点：村上整改排水沟本身并不违法，但必须在遵守相关法律法规的前提下进行。未经批准擅自整改或破坏排水功能等行为将可能构成违法。因此，建议村上在进行排水沟整改前，充分了解相关法律法规要求，并依法申请并获得批准。如有进一步需要，您可以继续咨询我。