老板欠钱跑路了，法院起诉和劳动仲裁不是由同一个人进行是可以的。法院起诉和劳动仲裁是两种不同的法律程序，分别处理不同类型的纠纷，它们可以由不同的人来提起，并不冲突。

1. 法院起诉：这通常涉及的是债务债权纠纷，即老板欠钱不还的问题。在这种情况下，你可以作为债权人，向法院提起民事诉讼，要求老板偿还欠款。法院会根据你提供的证据和法律规定，对案件进行审理，并作出判决。

2. 劳动仲裁：这则通常涉及的是劳动纠纷，比如老板未按时支付工资、未签订劳动合同等。在这种情况下，你可以向当地的劳动争议仲裁委员会提起劳动仲裁，要求维护你的合法权益。劳动仲裁委员会会根据你提供的证据和劳动法律法规，对案件进行裁决。

因此，如果老板既欠你钱又存在劳动纠纷，你可以同时选择向法院起诉和提起劳动仲裁来维护自己的权益。这两种程序是并行的，互不影响。当然，在提起这两种程序之前，建议你尽量收集好相关证据，以确保自己的权益能够得到有效维护。