单位私自卖一部分住房给员工不一定违法，关键取决于交易的具体情况和所遵循的法律程序。以下是对此问题的详细分析：
一. 单位私自卖房的法律性质
单位房的产权性质：单位房可能具有全部产权或部分产权。若单位对房屋拥有全部产权，则有权决定房屋的出售；若仅拥有部分产权，如职工集资建房按标准价购买的住房，单位在出售时可能受到一定限制。
交易的合法性：根据《中华人民共和国城市房地产管理法》第三十八条，未依法登记领取权属证书的房地产不得转让。因此，若单位出售的住房未取得房产证或其他合法产权证明，则私自出售是违法的。
二. 单位卖房给员工的合法性条件
产权清晰：单位在出售住房给员工前，必须确保房屋产权清晰，不存在任何产权纠纷。
合法程序：交易必须遵循合法的程序，包括签订书面合同、办理相关过户手续等。合同内容应明确双方的权利和义务，且不得违反法律、行政法规的强制性规定。
价格合理：单位出售住房给员工的价格应合理，不能低于成本价或违反相关政策规定。若以低于成本价或市场价格出售，可能涉及国有资产流失或税收问题。
三. 特殊情况下的合法性
住房制度改革期间的特殊规定：在住房制度改革期间，国家机关、企事业单位等可能按照所在地县级以上人民政府规定的房改成本价格向职工出售公有住房。此时，职工因支付的房改成本价格低于房屋建造成本价格或市场价格而取得的差价收益，可能免征个人所得税。但这一规定具有时效性，且需符合特定条件。
集资建房的规定：对于集资建房，单位或职工擅自向社会出售住房是违法的，但单位内部出售给符合条件的职工则可能合法。此时，需遵守《经济适用住房管理办法》等相关规定，如不得向非经济适用住房供应对象出售等。
总结：单位私自卖一部分住房给员工是否违法，取决于房屋的产权性质、交易程序、价格合理性以及是否遵守相关法律法规和政策规定。若单位拥有全部产权、交易程序合法、价格合理且遵守相关规定，则私自卖房给员工是合法的。反之，则可能构成违法。我建议单位在进行此类交易前，务必咨询专业律师或相关部门，确保交易的合法性和合规性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。