事业编正式员工不定等次和不合格相比，不合格更为严重。以下是对两者的详细分析：
一. 不定等次的含义与影响
含义：不定等次是指由于某种原因，无法确定考核对象的具体等次。在事业单位中，这通常出现在新录用公务员的试用期内，或者因员工特殊情况（如病假、事假等）导致考核周期内无法准确评估其工作表现的情况。
影响：不定等次对员工的个人发展有一定影响，但通常不会带来直接的负面后果。例如，它可能影响员工的薪资待遇，因为多数事业单位中员工的薪资待遇与年度考核结果紧密挂钩。但相比不合格等次，不定等次的影响较为有限，且一旦特殊情况解决，员工仍有机会获得正常的考核等次。
二. 不合格的含义与影响
含义：不合格是指员工在年度考核中被评定为未能达到工作要求的标准。这通常是由于工作态度消极、不能完成工作任务、违反工作纪律或存在其他严重失职行为等原因导致的。
影响：
经济影响：不合格员工将不发年终奖金，并可能受到批评教育。此外，不合格还可能影响员工的薪资待遇，包括核减绩效工资、不增加薪级工资等。
职业影响：不合格结果将作为员工个人档案中的不良记录，影响未来的晋升、调岗和职称评定。在事业单位中，连续多年考核不合格甚至可能导致降职、调整工作、低聘或解聘等严重后果。
法律后果：对于连续两年考核不合格的员工，事业单位有权根据相关规定采取进一步的处理措施，包括辞退等。辞退程序需严格履行法定程序，包括单位提出辞退意见、听取本人陈述和申辩、集体讨论决定以及报主管部门审批等。
三. 综合比较
我的观点：因此，在事业编正式员工中，不合格相比不定等次更为严重。员工应努力提升自己的工作表现，避免被评定为不合格等次。如有进一步需要，您可以继续咨询我。