劳动合同和总公司签的，起诉时一般不能在分公司的注册地起诉。具体分析如下：

1. 合同主体原则：

   • 劳动合同是与总公司签订的，因此合同的双方主体是劳动者和总公司。
   • 在发生劳动争议时，通常应当根据合同主体来确定管辖地。

2. 管辖地规定：

   • 根据《劳动争议调解仲裁法》及相关司法解释，劳动争议由劳动合同履行地或者用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会管辖。
   • “用人单位所在地”通常指的是总公司的所在地，而非分公司的所在地。

3. 特殊情况考虑：

   • 如果分公司具有独立法人资格，并且劳动者实际上是与分公司建立劳动关系（尽管合同是与总公司签订），那么可能可以考虑在分公司的注册地起诉。
   • 但这种情况较为罕见，且需要具体证据来证明劳动者与分公司之间的实际劳动关系。

4. 法律建议：

   • 在确定起诉地点前，建议劳动者先咨询专业律师，明确自己的合同主体和管辖地。
   • 如果存在管辖争议，可以在律师的协助下，通过法律途径解决。

综上所述，劳动合同与总公司签订的情况下，起诉时一般应选择在总公司的所在地或者劳动合同履行地的劳动争议仲裁委员会进行，而非分公司的注册地。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。