存款单上经办人没有盖章只有签字，该存款单仍然有效。具体分析如下：

一. 存款单的有效性分析

1. 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一百四十三条，一个民事法律行为要有效，需满足三个条件：行为人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或行政法规的强制性规定且不违背公序良俗。
2. 应用到存款单：存款单上的经办人签字，即表示其对该存款行为的确认，只要签字是真实的，且存款行为本身符合法律法规，那么该存款单就是有效的。盖章并非法律上的必须要求，签字同样具有法律效力。

二. 实际情境考量

• 在实际银行业务操作中，经办人的签字和盖章通常都视为对业务行为的确认。尽管盖章可能更为正式，但签字同样能够表达经办人的意愿和确认。
• 例如，如果一个人在银行办理存款时，银行工作人员只在存款单上签字而未盖章，这并不影响存款的实际发生和存款单的法律效力。

综上所述，存款单上经办人没有盖章只有签字，该存款单仍然有效。因为签字本身就是经办人对存款行为的确认，且符合民法典关于民事法律行为有效的规定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。