首先，需要明确的是，与小三断绝关系并签订协议，这本身并不是一个典型的法律程序，因为“小三”这一身份在法律上并没有明确的定义，也无法通过法律手段直接强制断绝某种关系。不过，如果你希望以一种较为正式和明确的方式来结束这段关系，并尽可能避免未来的纠纷，我可以给你一些建议。

1. 明确双方意愿：

   • 首先，你需要与对方进行坦诚的沟通，确保双方都同意结束这段关系，并愿意签订一份协议来明确彼此的权利和义务。

2. 协议内容要点：

   • 关系终止：明确声明双方同意终止不正当关系，并承诺未来不再有任何形式的联系或交往。
   • 财产处理：如果双方之间有财产往来或共同财产，应在协议中明确如何处理这些财产，包括分割、归还或补偿等。
   • 保密条款：可以考虑加入保密条款，要求双方对这段关系及协议内容保持秘密，不得向第三方透露。
   • 违约责任：约定如果一方违反协议，应承担的违约责任，包括赔偿损失、支付违约金等。

3. 协议形式与效力：

   • 虽然这份协议在法律上可能不具有强制执行力，但它仍然可以作为一份证据，证明双方曾经有过这样的约定。
   • 为了增强协议的可信度，你可以考虑邀请见证人在场见证，或者将协议内容以书面形式固定下来，并由双方签字确认。
   • 如果可能的话，还可以考虑将协议进行公证，虽然公证并不直接赋予协议法律执行力，但可以增加其证据效力。

4. 法律咨询：

   • 在签订协议之前，建议你咨询我的意见，确保协议内容的合法性和有效性，避免未来可能出现的法律纠纷。

最后，我要强调的是，虽然签订协议可以在一定程度上明确双方的权利和义务，但真正结束一段关系还需要双方的真诚和决心。如果你在这个过程中遇到任何法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。