违纪行为责任区分条款一般适用当时的规定。具体分析如下：

一. 违纪行为责任区分的基本原则

在处理违纪行为时，责任区分条款的适用原则通常遵循“法不溯及既往”的原则，即一般情况下，对违纪行为的处理应依据行为发生时的规定，而非行为后的新规定。这是因为法律或规章制度的变化不应影响已经发生的行为的法律后果，以保护行为人的合法权益和法律的稳定性。

二. 具体适用情况

1. 当时规定与最新规定一致：如果违纪行为发生时的规定与最新规定在责任区分上保持一致，那么无论适用哪个规定，结果都是相同的。

2. 当时规定与最新规定不一致：

   • 有利于行为人：如果最新规定对行为人更为有利（如处罚更轻或免责），但一般仍应适用当时的规定，除非有特别规定允许适用新规定。
   • 不利于行为人：如果最新规定对行为人更为不利（如处罚更重），则更应坚持适用当时的规定，以避免“事后法”的不公平现象。

三. 特殊情况的考虑

在某些特殊情况下，如法律或规章制度明确规定了“从新原则”或“有利原则”，则可能适用最新规定。但这需要具体根据法律或规章制度的内容来确定。

• 例如，某公司规章制度明确规定，对于某些特定类型的违纪行为，如果新规定更为有利，则适用新规定。在这种情况下，就需要根据新规定来处理相关违纪行为。

综上所述，违纪行为责任区分条款一般适用当时的规定，以保护行为人的合法权益和法律的稳定性。但在特殊情况下，如法律或规章制度有特别规定，也可能适用最新规定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。