写了离职申请但公司存在违规行为，你依然有权维护自己的合法权益。针对你的情况，我们可以从以下几个方面进行分析：
一. 公司违规行为的认定
违规行为的类型：公司的违规行为可能包括但不限于未按照劳动合同约定提供劳动条件、未及时足额支付劳动报酬、未依法缴纳社会保险费等。- 例如，如果你提出了离职申请，但公司在你离职前未支付你应得的工资或奖金，这就构成了违规行为。
违规行为的法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当履行劳动合同约定的义务，包括提供劳动条件、支付劳动报酬等。如公司存在违规行为，即违反了劳动合同法的相关规定。
二. 离职申请与违规行为的关系
离职申请的效力：你提出离职申请，是公司与你解除劳动关系的合法依据。但离职申请本身并不免除公司对于其违规行为的法律责任。- 例如，你提出了离职申请，并不能因此放弃追讨公司欠付的工资。
维护权益的途径：尽管你提出了离职申请，但如果你认为公司在劳动关系存续期间存在违规行为，你依然有权向劳动监察部门投诉，或者通过劳动争议仲裁、诉讼等途径维护自己的合法权益。
三. 具体行动建议
收集证据：在采取任何行动之前，建议你先收集好与公司违规行为相关的证据，如工资单、社保缴纳记录、劳动合同等。
与公司沟通：在掌握充分证据的基础上，你可以尝试与公司进行沟通，要求其纠正违规行为并赔偿你的损失。
法律途径：如果公司拒绝纠正违规行为或赔偿损失，你可以向劳动监察部门投诉，或者提起劳动争议仲裁、诉讼等。
我建议，在离职前确保自己的权益得到妥善保障，不要因为提出离职申请而放弃对公司违规行为的追责。如有进一步需要，您可以继续咨询我。