水利工程违法转包分包的处罚标准主要包括责令改正、没收违法所得、罚款、责令停业整顿、降低资质等级以及吊销资质证书等。具体处罚标准如下：

一. 责令改正与没收违法所得

• 根据《中华人民共和国建筑法》第六十七条，承包单位将承包的工程转包的，或者违反规定进行分包的，首先会被责令改正，并没收违法所得。

二. 罚款

• 同样依据《中华人民共和国建筑法》第六十七条，承包单位还将面临罚款的处罚。
• 根据《中华人民共和国招标投标法》第五十八条，中标人违法转包或分包的，处转让、分包项目金额千分之五以上千分之十以下的罚款。
• 《建设工程质量管理条例》第六十二条也规定，对施工单位处工程合同价款0.5%以上1%以下的罚款。

三. 责令停业整顿与降低资质等级

• 《中华人民共和国建筑法》第六十七条和《建设工程质量管理条例》第六十二条均规定，违法转包或分包的承包单位可以被责令停业整顿，并降低资质等级。

四. 吊销资质证书

• 在情节严重的情况下，根据《中华人民共和国建筑法》第六十七条和《建设工程质量管理条例》第六十二条，承包单位的资质证书可能会被吊销。

五. 连带赔偿责任

• 值得注意的是，根据《中华人民共和国建筑法》第六十七条，承包单位还需对因转包工程或者违法分包的工程不符合规定的质量标准造成的损失，与接受转包或者分包的单位承担连带赔偿责任。

综上所述，水利工程违法转包分包的处罚标准涵盖了多个方面，旨在严厉打击违法行为，保障水利工程的质量和安全。如有进一步需要，您可以继续咨询我。