公司收取1000元退休代理费是否合理，需根据具体情况判断，特别是要看公司是否提供了相应的服务以及双方是否有相关约定。以下是对此问题的详细分析：

一. 代理费收取的合理性分析

1. 服务内容与服务质量：公司若提供了专业的退休代理服务，如协助准备退休材料、办理退休手续等，并且服务质量良好，那么收取一定的代理费是合理的。但若公司只是简单地告知退休流程，并未提供实质性的服务，那么收取高额代理费则可能不合理。

2. 双方约定：如果员工与公司之间在入职时或退休前有相关约定，明确规定了退休代理费的金额和服务内容，那么按照约定执行即可。若无相关约定，公司单方面要求收取代理费，则可能缺乏合理性。

3. 行业惯例与市场价格：可以了解同行业中其他公司是否收取退休代理费以及收费标准如何。如果大多数公司都收取且收费标准相近，那么公司收取1000元代理费可能符合行业惯例。

二. 法律依据

• 虽然我国法律并未明确规定退休代理费的收取标准，但《中华人民共和国价格法》规定了经营者定价的基本依据和原则，即应当遵循公平、合法和诚实信用的原则，不得相互串通、操纵市场价格，损害其他经营者或者消费者的合法权益。因此，公司在收取退休代理费时，应当遵循这些原则，确保收费的合理性。

三. 结论与建议

• 结论：公司收取1000元退休代理费是否合理，需综合考虑服务内容、双方约定、行业惯例与市场价格等因素。若公司提供了实质性的服务且收费符合行业惯例和双方约定，那么收费可能是合理的。反之，则可能不合理。

• 建议：如果你认为公司收取的退休代理费不合理，可以与公司进行沟通协商，要求公司说明收费依据和服务内容。若沟通无果，你可以向当地价格主管部门投诉举报，以维护自己的合法权益。同时，我建议你在未来与公司签订相关协议时，明确约定退休代理费的相关事宜，以避免类似的纠纷发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。