一级注册结构证书在员工离职后，如企业不配合注销，可向省级住房城乡建设主管部门申请强制注销。具体分析如下：

一. 申请强制注销的主体与流程

1. 申请主体：根据相关规定，当注册单位或个人反映与另一方不存在聘用关系，而另一方不予配合办理注销或变更手续时，省级住房城乡建设主管部门是负责处理此类情况的主体。
2. 提交材料：个人需要提交解除劳动合同书面证明、劳动仲裁、司法判决等材料，作为申请强制注销的依据。
3. 办理流程：携带上述规定材料，前往省级住房城乡建设主管部门（或具体指定的办理机构，如天津市建筑市场服务中心）申请强制注销。

二. 法律依据

• 依据《住房和城乡建设部关于工程建设领域职业资格“挂靠”行为专项整治的补充通知》的规定，省级住房城乡建设主管部门有权依据一方申请及其提交的相关材料，直接办理注销手续。

三. 实际操作建议

• 先行协商：在申请强制注销前，建议首先尝试与企业进行协商，看是否能够和平解决注销问题。
• 准备材料：确保收集并准备好所有必要的申请材料，包括解除劳动合同书面证明、劳动仲裁裁决书或司法判决书等。
• 及时申请：一旦协商无果，应尽快向省级住房城乡建设主管部门提交申请，以避免因拖延而产生不必要的麻烦。

我建议，在离职后如遇到企业不配合注销一级注册结构证书的情况，应积极收集证据，按照上述流程向相关部门申请强制注销，以维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。