事业单位工作人员工会扣款标准为每月全部职工工资总额的百分之二。以下是具体的分析：

一. 扣款标准依据

• 根据《中华人民共和国工会法》第四十三条第二款规定：“建立工会组织的用人单位按每月全部职工工资总额的百分之二向工会拨缴的经费”。这一条款明确规定了工会经费的扣款标准，即事业单位作为用人单位，需要按照每月全部职工工资总额的百分之二向工会拨缴经费。

二. 扣款标准的适用范围

• 该扣款标准适用于所有建立工会组织的事业单位。这意味着，只要事业单位建立了工会组织，就需要按照这一标准向工会拨缴经费。

三. 扣款标准的执行

• 事业单位在每月发放工资时，应按照职工工资总额的百分之二计算工会经费，并及时拨缴给工会。这是事业单位作为用人单位的法定义务，也是保障工会正常运作和职工权益的重要措施。

综上所述，事业单位工作人员工会扣款标准明确为每月全部职工工资总额的百分之二，这一标准由《中华人民共和国工会法》明确规定，并适用于所有建立工会组织的事业单位。如有进一步需要，您可以继续咨询我。