旷工三天自离，用人单位可能会扣除上个月的工资，但具体是否扣除及扣除数额需根据用人单位的规章制度和法律规定来确定。
根据用人单位规章制度：
- 倘若用人单位在其内部的规章制度里对旷工扣工资这一事项作出了清晰且明确的规定，并且这些规定本身是合法有效的，那么依据此规定来扣除相应的工资便是合理的行为。
- 扣除的部分不应超出劳动者上月工资的百分之二十，同时扣除之后剩余的工资数额不得低于当地所规定的最低工资标准。
若用人单位规章制度未明确或不合理：
- 如果用人单位的规章制度并未明确提及旷工扣工资的相关事宜，又或者所规定的内容存在不合理之处，员工可以与用人单位进行协商来寻求解决办法。
- 协商无法达成一致时，员工有权向劳动监察部门进行投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
法律依据：
- 根据《劳动法》第五十条规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 劳动者付出劳动，用人单位按约定和法律规定支付报酬是应尽义务，上个月工资对应已完成劳动，用人单位无权无故克扣。但若旷工给单位造成经济损失，单位可从工资里扣除赔偿。
综上所述，旷工三天自动离职后，上个月的工资是否会被扣除，以及扣除的具体数额，都需要根据用人单位的规章制度以及相关的法律规定来进行确定。如果你在这方面遇到了问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供进一步的法律建议。