医院降低1000块钱绩效是否违法，需要根据具体情况来判断。

首先，我们要明确绩效工资的发放通常是基于员工的工作表现、公司的规章制度以及双方的劳动合同来确定的。如果医院有明确的绩效考核制度，并且该制度已经过员工的同意或确认（比如通过签署劳动合同或相关协议），那么医院按照考核制度来调整员工的绩效是合法的。

然而，如果医院在没有明确告知或未经员工同意的情况下，单方面降低员工的绩效，这可能涉嫌侵犯员工的合法权益。特别是当这种降低绩效的行为与员工的工作表现无关，或者与医院的规章制度相悖时，员工有权提出质疑。

此外，还需要考虑降低绩效的具体原因。如果是因为员工个人的工作失误或违规行为导致的绩效降低，且这种降低是合理的、有依据的，那么医院的行为通常不会被认为是违法的。但如果降低绩效的原因是不合理或不合法的，比如基于性别、种族、宗教等歧视性因素，那么这种行为就是违法的。

综上所述，要判断医院降低1000块钱绩效是否违法，需要综合考虑医院的绩效考核制度、降低绩效的具体原因以及员工的合法权益等因素。如果你认为医院的行为侵犯了你的合法权益，你可以通过法律途径来维护自己的权益，比如与医院协商、向劳动监察部门投诉或寻求法律援助等。在这个过程中，我建议你保留好所有相关的证据，以便更好地维护自己的权益。