在商铺征收中，关于一楼和二楼按不同标准置换的合法性，需要从多个角度进行分析。

首先，结论前置：商铺征收中一楼按元/平方米置换，二楼按0.5倍标准置换，这种做法的合法性取决于具体的征收补偿方案和法律规定。如果征收补偿方案经过合法程序制定，且符合相关法律法规的规定，那么这种置换方式就是合法的。反之，则可能存在违法之处。

接下来，我们从以下几个方面进行详细分析：

1. 征收补偿方案的制定程序：

   • 征收补偿方案应当由相关部门依法制定，并经过公告、听证等程序，确保被征收人的知情权、参与权和申诉权。
   • 如果征收补偿方案的制定程序存在瑕疵，如未履行公告、听证等程序，或者未充分听取被征收人的意见，那么该方案可能因程序违法而被认定为无效。

2. 征收补偿方案的内容：

   • 征收补偿方案应当明确补偿标准、补偿方式、补偿期限等关键内容。
   • 在商铺征收中，一楼和二楼的置换标准应当合理且公平。如果二楼的置换标准明显低于一楼，且没有合理的解释和依据，那么这种置换方式可能因内容不公平而被质疑其合法性。

3. 相关法律法规的规定：

   • 商铺征收涉及土地和房屋的征收与补偿，应当遵守《土地管理法》、《国有土地上房屋征收与补偿条例》等相关法律法规的规定。
   • 如果征收补偿方案违反了相关法律法规的规定，如未按照法定标准给予补偿，或者未履行法定的征收程序，那么该方案可能因违法而被撤销或变更。

4. 实际案例的参考：

   • 在实践中，商铺征收的置换标准因地区、房屋性质、用途等因素而异。
   • 可以参考类似地区的商铺征收案例，了解当地的置换标准和做法，以判断一楼和二楼按不同标准置换的合理性。

综上所述，商铺征收中一楼按元/平方米置换，二楼按0.5倍标准置换的合法性取决于具体的征收补偿方案和法律规定。如果征收补偿方案经过合法程序制定，且内容合理公平，符合相关法律法规的规定，那么这种置换方式就是合法的。如果被征收人对征收补偿方案有异议，可以通过法律途径维护自己的合法权益。