一楼商铺与二楼住宅打通是否合法，这并非一个简单的“是”或“否”的问题，而是需要根据具体情况和相关法律法规来综合判断。以下是我从不同角度为你进行的分析：

1. 建筑结构安全角度：

   • 打通一楼商铺与二楼住宅，首先需要考虑的是建筑结构的安全。如果这种打通行为会破坏建筑的承重结构，或者对建筑的整体稳定性造成影响，那么这种行为显然是不合法的。因为根据《中华人民共和国建筑法》等相关法律法规，任何对建筑结构的改动都需要经过专业设计，并确保改动后的建筑仍然符合安全标准。

2. 规划与审批角度：

   • 即使打通行为不会对建筑结构安全造成影响，也需要考虑是否符合当地的城市规划和建筑审批要求。如果未经相关部门审批就擅自进行打通，那么这种行为也是违法的。因为城市规划和建筑审批是确保城市建设和建筑活动有序进行的重要手段，任何违反规划和审批要求的行为都可能受到法律的制裁。

3. 相邻权角度：

   • 打通一楼商铺与二楼住宅还可能涉及到相邻权的问题。如果这种打通行为对二楼住宅的居住环境、采光、通风等造成了不良影响，或者侵犯了二楼住宅业主的合法权益，那么二楼住宅业主有权要求停止这种打通行为，并可能要求赔偿损失。因为根据《中华人民共和国民法典》中关于相邻权的规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。

4. 物业管理角度：

   • 如果该建筑有物业管理公司进行管理，那么打通行为还需要考虑是否违反了物业管理规定。物业管理公司通常会根据业主公约或相关法律法规制定物业管理规定，对建筑的使用、维护、改造等进行规范。如果打通行为违反了这些规定，物业管理公司有权要求停止并恢复原状。

建议：

• 在进行打通行为之前，建议先咨询专业的建筑结构工程师，确保打通行为不会对建筑结构安全造成影响。
• 同时，也需要向当地的城市规划部门和建筑审批部门咨询，了解打通行为是否符合规划和审批要求。
• 如果打通行为可能涉及到相邻权的问题，建议与二楼住宅业主进行充分沟通，确保打通行为不会对其造成不良影响。
• 最后，也需要遵守物业管理规定，确保打通行为不会违反相关规定。

如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律帮助。