合同协议到期，店内还有该品牌的商品不一定构成侵权，具体需根据实际情况判断。下面我将从几个角度详细分析这个问题：

1. 合同条款的约定：

   • 首先，需要查看合同协议中关于商品销售、品牌使用以及合同终止后的处理等相关条款。如果合同中明确规定了合同到期后商品的处理方式，比如需立即下架或可继续销售至库存清空等，那么应当严格按照合同约定执行。
   • 若合同未明确约定，则需要进一步分析其他因素。

2. 品牌授权情况：

   • 如果合同协议是基于品牌授权而签订的，那么合同到期后，品牌授权也随之终止。此时，如果继续销售该品牌的商品，就可能构成侵权，因为已经没有了合法的品牌使用授权。
   • 但如果品牌方在合同到期后给予了宽限期，或者双方达成了新的口头或书面协议允许继续销售，那么则不构成侵权。

3. 商品来源与性质：

   • 需要考虑店内剩余商品的来源是否合法，以及商品本身是否涉及知识产权等复杂问题。如果商品是通过合法渠道进货，并且没有侵犯任何知识产权，那么仅因为合同到期而继续销售这些商品，通常不会构成侵权。
   • 但如果商品本身存在侵权问题，比如假冒伪劣产品，那么无论合同是否到期，销售这些商品都是违法的。

4. 法律后果与建议：

   • 如果合同到期后继续销售该品牌商品构成侵权，那么可能会面临品牌方的法律追究，包括赔偿损失、承担侵权责任等。
   • 因此，建议在合同到期前与品牌方进行沟通，明确合同到期后的商品处理方式。如果合同已经到期，且没有明确的处理方式，那么应当谨慎行事，避免构成侵权。

综上所述，合同协议到期后店内还有该品牌的商品是否构成侵权，需要根据合同条款、品牌授权情况、商品来源与性质等多个因素进行综合分析。如果你面临这样的情况，建议尽快与品牌方或专业律师进行沟通，以明确法律责任和后续处理方式。