离职扣全勤奖从工资扣是否合法，主要取决于劳动合同、公司规章制度以及相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细分析：

1. 劳动合同或集体合同的约定：

   • 如果劳动合同或集体合同中明确规定了全勤奖的发放条件、标准及离职时的处理方式，且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么双方均应遵守这些约定。例如，合同可能规定，即使员工离职，只要符合全勤条件，就应支付全勤奖；或者规定离职时全勤奖不予支付。
   • 若劳动合同或集体合同中没有相关规定，或规定不明确，则需要参考公司规章制度及劳动法的相关规定。

2. 用人单位的规章制度：

   • 用人单位有权自主设定福利制度，包括全勤奖，但需在合法的前提下进行。
   • 规章制度应经过民主程序制定，并向员工公示，确保其知晓并同意相关内容。
   • 如果规章制度中规定了离职时全勤奖的扣除情况，且该规定合法有效，那么用人单位可以按照规章制度执行。

3. 劳动法的规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。全勤奖作为工资的一部分，同样受此保护。
   • 如果用人单位无故克扣全勤奖，劳动者有权向劳动行政部门投诉，要求支付被扣除的全勤奖及可能的赔偿金，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

4. 具体处理情况：

   • 通常情况下，如果劳动者在提出离职申请到正式离职的当月未能出满勤，根据全勤奖的通常定义（即当月正常上班且无迟到早退行为），劳动者可能无权获得该月的全勤奖。
   • 但如果存在特殊约定，如劳动合同或集体合同中特别规定离职也能根据出勤天数按比例获得全勤奖，或者规定离职时不扣除全勤奖，那么用人单位应按照约定执行。

综上所述，离职扣全勤奖从工资扣是否合法，需要综合考虑劳动合同、公司规章制度及劳动法的相关规定。如果劳动者认为自己的全勤奖被不合理扣除，可以先与公司进行友好协商；协商不成时，可以依法向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。