针对您提出的“两辆电瓶车相撞，对方主要责任但她不同意，要走法律程序，电瓶车被扣了”的问题，以下是我的详细解答：
首先，明确结论：
在电瓶车相撞事故中，若对方承担主要责任但不同意赔偿，您有权通过法律程序来维护自己的合法权益。同时，电瓶车被扣是事故处理的一部分，通常用于事故调查和责任认定。
接下来，分情况详细解释：
事故责任认定：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，交通事故的责任认定由公安机关交通管理部门进行。若对方承担主要责任，公安机关交通管理部门会出具相应的责任认定书。
- 如果对方对责任认定有异议，可以在收到认定书之日起三日内向出具认定书的公安机关交通管理部门提出书面复核申请。
法律程序处理：
- 若双方无法就赔偿事宜达成一致，您可以选择向公安机关交通管理部门申请调解，或者直接向人民法院提起民事诉讼。
- 提起民事诉讼时，您需要准备相关证据材料，包括事故责任认定书、医疗费用单据、收入损失证明等，以支持您的赔偿请求。
电瓶车被扣的处理：
- 电瓶车被扣通常是为了进行事故调查和责任认定。在事故处理完毕后，公安机关交通管理部门会根据责任认定结果和相关规定，决定电瓶车的归还或进一步处理。
- 如果您的电瓶车被扣，您可以向扣车的公安机关交通管理部门了解相关情况和处理流程。
最后，给出建议：
- 在处理此类事故时，建议您保持冷静，理性面对。尽量收集并保留好相关证据，如事故现场照片、视频、目击者证言等，以便后续处理。
- 如果您在法律程序处理过程中遇到任何问题或困难，可以随时向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业的法律建议和指导。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。