首先，针对您提到的“水田第二次确权本人种水稻被第一次人破坏水稻侵权”的情况，我们可以明确的是，如果他人故意或过失破坏了您的水稻，这确实可能构成侵权，您有权要求侵权人承担相应的法律责任。

1. 确认侵权行为：

   • 您需要首先收集证据，证明水稻确实被他人破坏，以及破坏的程度和损失。这可以包括现场照片、视频、证人证言等。
   • 确认破坏行为是否由特定的个人或团体实施，以及他们是否有故意或过失的动机。

2. 寻求法律救济：

   • 民事赔偿：您可以向侵权人提出民事赔偿要求，包括水稻的损失、种植成本、可能的收益损失等。这需要您提供充分的证据来支持您的赔偿请求。
   • 行政或刑事责任：如果破坏行为严重，可能涉及行政违法或刑事犯罪，您可以向当地公安机关报案，要求追究侵权人的行政或刑事责任。

3. 确权问题：

   • 您提到“水田第二次确权”，这可能意味着土地权属存在争议。在处理侵权问题的同时，您也需要关注土地确权的问题。
   • 如果土地权属确实存在争议，您可能需要通过法律途径来解决，比如向当地土地管理部门申请确权，或者通过诉讼来明确土地权属。

4. 法律咨询与援助：

   • 在处理这类复杂问题时，建议您咨询专业的律师，以便获得更具体的法律建议和指导。
   • 如果您需要法律援助或进一步的法律咨询，我可以为您提供帮助。您可以详细描述您的情况，我会根据您的具体情况给出更详细的法律建议。

综上所述，面对水稻被破坏的侵权问题，您应该首先确认侵权行为并收集证据，然后寻求法律救济。同时，如果土地权属存在争议，也需要尽快解决。在整个过程中，如果您有任何法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。