如果发现自己的耕田被别人确权在一起，应当向当地农村土地承包管理部门或相关政府机构进行投诉和申诉。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律背景与依据
根据《中华人民共和国农村土地承包法》的相关规定，农村土地承包经营权确权登记颁证工作应当遵循“依法、自愿、有偿”的原则，确保承包地块的权属清晰、面积准确、四至清楚。如果发现自己的耕田被错误地确权在他人名下，这明显违反了法律规定，侵犯了您的合法权益。
二、投诉与申诉途径
向当地农村土地承包管理部门投诉：
- 您可以首先向当地的农村土地承包管理部门（如乡镇农业服务中心或县级农业农村局）反映情况，提交相关证据材料，如土地承包合同、土地承包经营权证、身份证明等，要求他们进行调查核实并纠正错误。
向相关政府机构申诉：
- 如果当地农村土地承包管理部门未能及时解决问题或您对其处理结果不满意，您可以向更上一级的政府机构（如县级或市级人民政府）进行申诉，请求他们介入处理。
三、可能需要的证据材料
在投诉和申诉过程中，您需要准备充分的证据材料来支持自己的主张。这些证据材料可能包括但不限于：
- 土地承包合同：证明您与发包方之间存在土地承包关系。
- 土地承包经营权证：证明您对特定地块享有承包经营权。
- 身份证明：证明您的身份和与土地承包关系的关联性。
- 其他相关证据：如土地测绘图、现场照片、证人证言等，用于证明土地的实际使用情况和权属状况。
四、法律后果与风险提示
如果投诉和申诉成功：
- 相关部门将纠正错误的确权登记，将耕田重新确权在您名下，并可能对您因此遭受的损失给予一定的补偿。
如果投诉和申诉未成功：
- 您可能需要考虑通过法律途径解决争议，如提起行政诉讼或民事诉讼。在此过程中，您需要聘请专业律师来协助您处理法律事务，确保您的权益得到充分保障。
- 同时，您也需要注意诉讼时效和证据收集等问题，避免因错过诉讼时效或证据不足而导致败诉。
五、建议与措施
及时咨询专业律师：
- 在处理此类纠纷时，建议您及时咨询专业律师，了解自己的法律权益和可行的法律途径。律师将能够为您提供专业的法律意见和帮助您制定有效的维权策略。
保持冷静与理性：
- 在处理纠纷过程中，请保持冷静与理性，避免采取过激行为或言语攻击等不当方式。这有助于维护您的形象和声誉，也有助于纠纷的妥善解决。
积极配合相关部门调查：
- 在相关部门进行调查时，请积极配合他们的工作，提供必要的证据材料和协助。这有助于加快调查进度和提高处理效率。
如果您在处理此类纠纷过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将竭诚为您提供专业的法律服务。