关于您提出的“合同约定凭正式发票及签收单据通过对公银行账号转账进行结算，诉讼时效如何计算”的问题，我可以为您详细解答。

首先，结论上，诉讼时效的计算通常与合同约定的结算方式无直接关联，而是依据法律规定的诉讼时效期间以及是否存在诉讼时效中断、中止等情形来确定。

1. 诉讼时效期间的确定：

   • 根据我国相关法律规定，一般的诉讼时效期间为三年。这意味着，自权利人知道或者应当知道自己的权利受到损害以及义务人之日起三年内，权利人可以向人民法院请求保护其民事权利。
   • 如果合同中有特别约定诉讼时效期间，且该约定不违反法律强制性规定，那么应按照合同约定的期间来计算诉讼时效。

2. 诉讼时效的中断与中止：

   • 诉讼时效中断：在诉讼时效期间内，如果权利人向义务人提出履行请求，或者义务人同意履行义务，或者权利人提起诉讼、申请仲裁等，都会导致诉讼时效中断。从中断时起，诉讼时效期间重新计算。
   • 诉讼时效中止：在诉讼时效期间的最后六个月内，如果因不可抗力或者其他障碍不能行使请求权的，诉讼时效中止。自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。

3. 与结算方式的关联：

   • 虽然合同约定了凭正式发票及签收单据通过对公银行账号转账进行结算，但这并不直接影响诉讼时效的计算。结算方式只是合同履行的一部分，它决定了款项的支付方式和时间，但并不决定诉讼时效的起算、中断或中止。

综上所述，诉讼时效的计算与合同约定的结算方式无直接关联，而是依据法律规定的诉讼时效期间以及是否存在诉讼时效中断、中止等情形来确定。如果您在诉讼时效方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。