上48小时休96小时，在特定情况下可能是合法的，但也可能违法，具体取决于该工作制是否经过劳动行政部门的批准以及是否保障了劳动者的合法权益。

1. 合法性分析：

   • 若该工作制已经劳动行政部门批准，并且确保了劳动者的合法权益未受侵犯（如保证了足够的休息时间、支付了相应的加班费等），则此安排属于合法范畴。
   • 若未经批准，用人单位擅自实行此工作制，且侵犯了劳动者的休息权益（如未支付加班费、未保证足够休息时间等），那么此安排则是违法的。劳动者有权向劳动行政部门举报，以维护自身合法权益。

2. 工时制度规定：

   • 合法工时制度规定，劳动者每日工作时间不超过八小时，平均每周工作时间不超过四十四小时。
   • 用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。
   • 对于因生产特点不能实行标准工时制度的企业，经劳动行政部门批准后，可以实行其他工作和休息办法，但同样需确保劳动者的合法权益不受侵犯。

3. 建议与提醒：

   • 劳动者在面对非标准工时制度时，应了解自己的权益，确保工作安排符合法律法规的要求。
   • 如发现自身权益受到侵犯，应及时向劳动行政部门举报，寻求法律援助。
   • 用人单位在制定工作制度时，也应遵守相关法律法规，确保劳动者的合法权益得到保障。

综上所述，上48小时休96小时的合法性取决于具体情况。若你有进一步的疑问或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。