当电动自行车在超车过程中发生碰撞时，处理方式和责任判定主要遵循以下步骤和原则：

一、立即停车并保护现场

首先，发生碰撞后应立即停车，并确保自己和其他涉事人员的安全。同时，尽量保护现场不受破坏，以便后续的责任判定和事故调查。

二、报警并等待交警到来

及时报警是处理交通事故的重要步骤。交警会到现场进行勘查、拍照、调查，并根据调查结果和鉴定来制作交通事故报告。这份报告是处理事故的关键证据，会明确说明事故的主要原因、责任划分等。

三、责任判定

根据《道路交通事故处理程序规定》和《道路交通安全法》的相关规定，责任判定主要依据当事人的行为对发生道路交通事故所起的作用以及过错的严重程度来确定。具体来说：

1. 一方过错：如果事故是由一方当事人的过错导致的，那么该方将承担全部责任。
2. 多方过错：如果事故是由两方或多方当事人的过错共同导致的，那么将根据各自在事故中的作用和过错程度，分别承担主要责任、同等责任和次要责任。
3. 无过错：如果各方当事人均无明显过失，那么事故将被视为交通意外，各方均无需承担责任。

四、协商处理或诉讼

在责任判定后，双方可以尝试通过协商来解决赔偿等问题。如果协商不成，可以依法向人民法院提起诉讼，由法院根据事实和法律进行裁决。

五、遵守交通规则，预防事故

最后，需要强调的是，遵守交通规则、谨慎驾驶是预防交通事故的关键。在超车时，应确保安全、遵守交通信号和标志，避免盲目超车或违规操作。

综上所述，电动自行车超车中发生碰撞时，应立即停车保护现场、报警等待交警处理、根据责任判定进行协商或诉讼，并时刻牢记遵守交通规则、预防事故的发生。