关于“承包地被划入保护区是否合法”的问题，需要从多个角度进行分析。

首先，从法律层面来看，我国《土地管理法》、《农村土地承包法》等法律法规并未直接规定承包地不能被划入保护区。保护区的设立通常是为了保护特定的自然资源、生态环境或文化遗产，这是基于公共利益的需要。因此，如果政府依法定程序将承包地划入保护区，并给予了合理的补偿或安置，那么这一行为在法律上是合法的。

其次，从实际操作层面来看，承包地被划入保护区是否合法，还取决于具体的实施过程和补偿措施。政府在进行此类决策时，应当遵循法定程序，包括听证、公告、征求意见等，确保农民的知情权、参与权和申诉权。同时，政府还应当给予农民合理的补偿或安置，以保障其合法权益不受损害。

最后，从农民权益保护层面来看，如果承包地被划入保护区导致农民无法继续耕种或收益受到重大影响，农民有权要求政府给予相应的补偿或安置。政府应当与农民进行协商，达成双方都能接受的补偿方案。如果政府未能履行其法定义务，农民可以通过法律途径维护自己的合法权益。

综上所述，承包地被划入保护区本身并不违法，但政府在实施过程中必须遵循法定程序，并给予农民合理的补偿或安置。如果农民对此有异议或认为自己的权益受到侵害，可以及时向政府反映情况并寻求法律帮助。如果你在这方面遇到了具体问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。