合同约定三个法院管辖协议是否有效，需具体情况具体分析。
有效的情况：
- 如果合同约定的三个法院都与争议有实际联系，比如被告住所地、合同履行地、合同签订地等，并且不违反级别管辖和专属管辖的规定，那么这个管辖协议就是有效的。在这种情况下，当事人可以根据自身需求，从中选择一个法院去提起诉讼。
无效的情况：
- 如果约定的法院中有与争议没有实际联系的，或者违反了级别管辖、专属管辖的规定，那么这个管辖约定就可能会被认定为无效。
- 另外，如果合同约定的多个管辖法院导致无法明确具体由哪个法院来管辖，即约定过于宽泛模糊，那么该管辖协议同样会被认定无效。
综上所述，判断合同约定三个法院管辖是否有效，重点在于看是否符合法律对协议管辖的相关规定。只有符合规定，约定才具有法律效力，当事人的权益才能得到保障。如果你在这方面有具体的合同或纠纷，可以将详细情况告诉我，我会为你提供更具体的法律分析和建议。