是的，小工程发票通常也需要有合同。以下是对此结论的详细解释：
合同的重要性：无论工程大小，合同都是双方约定权利义务的重要法律依据。它明确了工程的具体内容、价格、付款方式、施工期限、质量标准以及违约责任等关键条款。有了合同，双方在发生争议时就能有据可依，更容易维护各自的合法权益。
发票与合同的关系：发票是交易凭证，证明了款项的支付和收取。而合同则是交易的基础，是发票开具的依据。没有合同作为支撑，发票的合法性、真实性以及关联性都可能受到质疑。特别是在税务审计或法律纠纷中，合同和发票往往需要同时提供，以证明交易的合法性和真实性。
小工程的特殊性：虽然小工程可能涉及金额不大，但并不意味着可以忽视合同的签订。实际上，正是因为金额小、操作灵活，才更容易出现口头约定、随意更改等情况，导致后续纠纷频发。因此，即使是小工程，也应该签订正式的书面合同，并据此开具发票。
综上所述，无论是从法律角度还是税务角度考虑，小工程发票通常都需要有合同作为支撑。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。