综合工时制下，年假和病假通常不计入工时。以下是对这一结论的详细解释：
年假不计入工时
法律依据：根据《职工带薪年休假条例》第二条，职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假。单位应当保证职工享受年休假，且职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。由此可见，年假是职工依法享受的带薪休假，其性质并非工作时间，因此不计入综合工时制的工时。
年假的计算：年假的计算与职工在不同单位累积的工作年限相关，与工时制度无直接关联。具体规定为：累计工作1-10年享5天年假，10-20年享10天，20年以上享15天。
病假不计入工时
病假性质：病假是员工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时享受的休假权益。其目的是为了保障员工的健康，提供休息和治疗的时间。因此，病假并非员工为了完成工作任务而投入的有效工作时间。
法律未明确规定：虽然相关法律法规并未明确规定综合工时制下病假必须计入或不计入工时，但考虑到病假的特殊性质以及综合工时制的核算原则（围绕劳动者实际付出的劳动量进行核算），病假时间通常不应计入实际工作工时。
特殊情况处理：在某些特殊情况下，如用人单位按照正常出勤工资标准支付劳动者病假期间的工资，或者劳动合同、规章制度中有特别约定，病假可能会计入工时。但这需要根据具体情况和相关法律法规进行综合判断。
综上所述，综合工时制下，年假和病假通常不计入工时。这是基于法律法规的规定以及年假和病假的特殊性质得出的结论。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。