关于“加工程序不合法怎么处理”的问题，这通常涉及到建设工程领域的合同纠纷或违法行为处理。以下是我根据相关法律法规和实务经验给出的建议：

首先，我们需要明确“加工程序不合法”的具体含义。这可能包括未取得相应许可进行建设、违反建设规划、施工质量不符合标准、违反环保规定等多种情况。

1. 合同层面：

   • 如果加工程序不合法是由于合同一方（如承包商）的违约行为导致的，另一方（如发包方）可以依据合同条款追究其违约责任。这可能包括要求违约方承担修复费用、赔偿损失、支付违约金等。
   • 同时，如果合同中有关于加工程序合法性的明确约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么该约定将作为判断双方权利义务的重要依据。

2. 法律层面：

   • 对于未取得相应许可进行建设的行为，根据相关法律法规，可能会面临行政处罚，如罚款、责令停工等。在严重情况下，甚至可能构成犯罪，需要承担刑事责任。
   • 如果加工程序不合法导致工程质量问题或安全事故，相关责任方可能需要承担民事赔偿责任，包括赔偿受害人的损失、修复费用等。
   • 对于违反环保规定的行为，还可能面临环保部门的处罚，如罚款、限期整改等。

3. 实务建议：

   • 在发现加工程序不合法后，首先应立即停止违法行为，避免损失进一步扩大。
   • 随后，应尽快咨询专业律师或相关机构，了解具体的法律责任和应对策略。
   • 如果可能，应尽快与合同对方协商解决方案，如修改合同条款、达成赔偿协议等。
   • 同时，也应积极配合相关部门的调查和处理，以便尽快解决问题并恢复正常的建设秩序。

综上所述，处理加工程序不合法的问题需要从合同和法律两个层面进行综合考虑。在具体操作中，应根据实际情况制定针对性的解决方案，并尽快采取行动以减少损失和风险。如果您有具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。