400万以上的建设工程在一定条件下确实可以通过政府采购网进行招标，这主要取决于项目是否满足政府采购的特定条件。以下是对此问题的详细解答：
一、满足政府采购条件的情况
若工程项目同时满足以下条件，则可纳入政府采购范畴，并通过政府采购网进行招标：
采购主体合规：采购主体必须是各级国家机关、事业单位和团体组织。例如，某政府部门为建设公共设施而开展的造价超过400万的工程项目，由于采购主体为政府部门，因此符合这一条件。
资金来源明确：项目资金应来源于财政性资金，这包括财政预算资金和预算外资金。如果项目资金是由财政拨款或政府性基金等财政性资金支持的，那么该项目就满足资金来源的条件。
符合采购目录或限额标准：工程项目需列入省级以上人民政府公布的集中采购目录，或虽未列入但达到采购限额标准。根据相关规定，施工单项合同估算价在400万元人民币以上的工程项目必须进行招标，而这类招标项目通常也纳入政府采购的范畴。
遵循相关法律法规：政府采购工程进行招标投标的，还需遵循《中华人民共和国招标投标法》及《中华人民共和国政府采购法》的相关规定，确保招标过程的公开、公平、公正。
二、不属于政府采购或不能通过政府采购网招标的情况
若工程项目不满足上述任一条件，则可能不能通过政府采购流程进行招标，或者不属于政府采购项目：
非特定采购主体：若采购主体为企业等其他非国家机关、事业单位和团体组织性质的单位，如民营企业投资建设的项目，则不属于政府采购范畴。
非财政性资金：若项目资金完全来自企业自有资金、银行贷款或其他非财政性资金渠道，则该项目不能通过政府采购方式进行招标。
涉及特殊情况：如涉及国家安全和秘密的采购项目、小额零星采购项目以及因预算单位不可预见的原因急需开展的采购项目等，可能有特殊的采购流程和要求，不一定需要通过政府采购网进行招标。
三、实际操作注意事项
在具体操作时，还需注意以下几点：
了解当地政策：不同地区的政府采购政策可能存在差异，因此在进行政府采购前，应充分了解并遵循当地的相关规定和要求。
公开采购意向：除涉及特殊情况的采购项目外，采购单位通常需要在政府采购网上公开采购意向，以便供应商及时了解并参与招标活动。
遵循招标流程：在招标过程中，应严格按照事先公布的采购项目、采购条件以及评价标准和方法进行，确保招标过程的合法性和规范性。
综上所述，400万以上的建设工程在满足特定条件的情况下是可以通过政府采购网进行招标的。然而，在实际操作中需严格遵循相关法律法规和政策要求，确保招标过程的合法性和规范性。