在办理抵押权登记时，一般不会直接扣押房产证原件。以下是对这一问题的详细解答：

一、抵押权登记与房产证扣押的情况

1. 通常情况：

   • 在办理房产抵押登记时，登记机关通常会在房产证上作出他项权利记载，然后会将房产证原件交还抵押人。
   • 同时，登记机关会向抵押权人颁发他项权证，这是证明抵押权存在的关键文件。

2. 特殊情况：

   • 尽管不常见，但在某些特殊情况下，可能会出现扣押房产证原件的情形。
   • 例如，双方在抵押合同中明确约定抵押人需将房产证原件交由抵押权人保管。
   • 或者抵押权人基于某些特殊风险考量，通过合法途径要求抵押人交付房产证原件，并获得法院等有权机关的支持。

二、法律依据

• 根据《城市房地产抵押管理办法》的相关规定，抵押房屋不需要扣留房产证，而是会在房产证上作出权利记载。
• 民法典对抵押登记后是否扣留房产证没有直接规定，但通过上述管理办法可以明确，抵押房屋不需要扣留房产证原件。

三、房屋抵押所需材料

• 在办理房地产抵押登记时，抵押双方需要准备一系列法律文件，包括但不限于：营业执照复印件、身份证明或法人代表证明书、借款合同（主合同）、抵押合同、抵押物的产权证明等。

四、总结

综上所述，办理抵押权登记时，一般不会扣押房产证原件。房产证原件对于抵押人可能仍有一定用途，如房产交易、处置等环节。而他项权证则是证明抵押权存在的关键文件，能够保障抵押权人的权益。在特殊情况下，如需扣押房产证原件，应基于合法合理的依据，并遵循相关法律法规的规定。