新增建设用地有偿使用费应由取得新增建设用地的县、市人民政府缴纳，具体由财政部门负责。以下是对这一结论的详细解释：

一、缴纳主体及责任部门

• 缴纳主体：根据相关法律法规，新增建设用地有偿使用费明确由取得新增建设用地的县、市人民政府作为缴纳主体。这意味着，当县、市人民政府通过出让等有偿方式取得新增建设用地时，需承担缴纳该费用的责任。
• 责任部门：在具体操作上，这笔费用由县、市人民政府的财政部门负责缴纳。这确保了费用的及时、准确缴纳，并明确了政府部门内部的职责分工。

二、费用性质与用途

• 费用性质：新增建设用地有偿使用费是国务院或省级人民政府在批准农用地转用、征收土地时，向以出让等有偿方式取得新增建设用地的市、县人民政府收取的平均土地纯收益。它体现了国家对土地资源经济价值的认可和调控。
• 费用用途：该费用主要用于耕地开发等相关的土地整治和保护项目。通过这笔费用的投入，可以促进耕地的有效开发和保护，维护国家粮食安全，实现土地资源的可持续利用。

三、缴纳要求与后果

• 缴纳要求：县、市人民政府应严格按照规定标准和程序缴纳新增建设用地有偿使用费。这是遵守国家法律法规、确保土地资源合理利用和耕地保护制度有效实施的重要举措。
• 未缴纳的后果：若未按规定缴纳新增建设用地土地有偿使用费，将不予办理新增建设用地手续。这一规定旨在防止土地资源的浪费和滥用，体现了国家对土地资源的严格管理和对违规行为的零容忍态度。

四、法律依据

• 《中华人民共和国土地管理法》第五十五条第二款规定：自本法施行之日起，新增建设用地的土地有偿使用费，百分之三十上缴中央财政，百分之七十留给有关地方人民政府，都专项用于耕地开发。
• 《中华人民共和国土地管理法实施条例》第三十条进一步解释了《土地管理法》第五十五条规定的新增建设用地的土地有偿使用费的性质。

综上所述，新增建设用地有偿使用费的缴纳是县、市人民政府的一项重要责任，也是国家土地资源管理的重要环节。通过明确缴纳主体、责任部门、费用性质与用途以及缴纳要求与后果，可以确保土地资源的合理利用和耕地保护制度的有效实施，促进经济社会的可持续发展。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。