有直接亲属关系的人能分别担任有限公司的法人。在我国，《中华人民共和国公司法》并未明确禁止有直接亲属关系的人分别担任不同有限公司的法人。法人的任职资格主要关注个人的行为能力、信用状况以及是否符合公司章程的规定，而不是基于其与他人的亲属关系。

以下是具体的分析：

1. 法律依据：

   • 《中华人民共和国公司法》第十三条规定：“公司法定代表人依照公司章程的规定，由董事长、执行董事或者经理担任，并依法登记。”此条款说明了法定代表人的产生方式，但并未提及亲属关系作为限制条件。

2. 法人资格与亲属关系：

   • 有限公司的法人资格是独立的，每个公司都有其独立的法人财产和法人资格。因此，即使两个人有直接亲属关系，他们也可以分别担任不同公司的法人，只要他们符合各自公司的章程规定，并具备相应的行为能力和信用状况。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 虽然法律没有禁止，但在实际操作中，如果直接亲属关系涉及到公司的利益冲突、关联交易或可能的公司治理问题，那么相关监管机构或投资者可能会对此持谨慎态度。
   • 此外，如果直接亲属同时担任多个公司的法人，且这些公司之间存在业务往来或竞争关系，那么需要特别注意避免违反公司法中关于关联交易、竞业禁止等规定。

综上所述，有直接亲属关系的人能分别担任有限公司的法人，但在实际操作中需要遵守公司法及相关法律法规的规定，并确保公司治理的透明度和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。