关于营业执照房屋鉴定费用由谁承担的问题，这主要取决于具体的政策规定和实际情况。以下是对此问题的详细解答：
首先，要明确的是，房屋安全鉴定是确保房屋使用安全的必要手段，特别是对于经营性自建房，进行房屋安全鉴定是取得经营许可的前置条件。在房屋安全鉴定中，会涉及费用问题，这通常包括鉴定机构的收费以及可能产生的其他相关费用。
对于营业执照房屋鉴定费用的承担，一般来说，遵循以下原则：
房屋所有权人承担：在大多数情况下，房屋安全鉴定的费用应由房屋所有权人（即房东）承担。这是因为房屋所有权人是房屋的安全责任人，有责任确保房屋的安全性能符合相关要求。
政府补助：在某些地区或特定情况下，政府可能会为经营性自建房的房屋安全鉴定提供一定比例的补助。例如，有的地区规定经营性自建房鉴定所需费用房主承担60%，政府补助40%。但具体的补助政策会因地区而异，需要参考当地的相关政策文件。
特殊情况：对于某些特殊情况，如房屋所有权人下落不明、房屋权属不清或有代管人等，费用的承担可能会根据具体情况进行协商或按照相关法律法规进行确定。
此外，还需要注意的是，房屋安全鉴定报告的有效期一般为一年。如果在有效期内需要重新办理工商执照或房屋使用功能发生变更等，可能需要重新进行房屋安全鉴定并产生相应的费用。
综上所述，营业执照房屋鉴定费用的承担主体主要是房屋所有权人，但在某些地区或特定情况下，政府可能会提供一定的补助。因此，在进行房屋安全鉴定前，建议咨询当地相关部门或机构以了解具体的政策规定和费用承担情况。