当员工因醉驾被免于起诉时，单位应依据相关法律法规、内部规章制度以及实际情况，采取合理且合法的处理措施。以下是对此问题的详细分析：

一、处理原则

单位在处理醉驾免于起诉的员工时，应遵循以下原则：

1. 依法依规：依据国家法律法规和单位内部规章制度进行处理。
2. 公平公正：确保处理决定公平公正，不偏袒任何一方。
3. 教育与惩戒相结合：既要对员工的违法行为进行惩戒，也要加强教育引导，提升其法律意识和安全意识。

二、具体处理措施

1. 内部纪律处分

   • 若单位规章制度中已明确规定对违法犯罪行为的处理措施，即使员工醉驾被免于起诉，单位也可依据规定给予警告、记过、降职、撤职等纪律处分。
   • 若规章制度未直接针对醉驾免于起诉情形作出规定，但设有“严重违反单位劳动纪律和职业道德”等兜底条款，单位需结合醉驾行为的具体影响进行综合判断。若认为行为严重，可启动纪律处分程序，但需确保处理决定的合理性和证据支撑。

2. 岗位调整

   • 考虑到醉驾行为反映出的安全意识和自我约束问题，单位可将员工调整至安全风险较低、不涉及重要业务或驾驶相关职责的岗位。
   • 此举既体现了对员工错误行为的惩戒，又保证了员工能继续为单位服务并发挥价值。

3. 教育培训

   • 单位应组织针对该员工的专项教育培训，内容涵盖法律法规、交通安全知识等。
   • 通过培训提升员工的法律意识和安全意识，同时对其他员工起到警示作用，避免类似行为再次发生。

4. 特殊情况处理

   • 对于特定行业（如交通运输、食品药品安全、金融等）受监管部门严格管理的情况，单位需按照监管部门的要求对醉驾免于起诉的员工进行严肃处理，甚至可能禁止其继续从事特定岗位工作。
   • 若醉驾者为事业单位工作人员，虽被免于起诉，但单位仍应根据具体情况给予降低岗位等级处分；若造成不良影响，则可给予开除处分。

三、注意事项

1. 确保处理决定的合法性：单位在处理员工时，应确保处理决定的合法性，避免引发劳动纠纷。
2. 加强内部管理和教育引导：单位应加强内部管理和教育引导，提升员工的法律意识和安全意识，共同营造安全、和谐的工作环境。
3. 关注员工心理变化：醉驾免于起诉后，员工可能面临心理压力和困扰，单位应关注其心理变化，提供必要的心理支持和帮助。

综上所述，单位在处理醉驾免于起诉的员工时，应依法依规、公平公正地采取合理且合法的处理措施。同时，加强内部管理和教育引导，提升员工的法律意识和安全意识，共同维护单位的安全和稳定。