灵活就业人员社保缴费完，后期对公司缴费一般没有影响。下面我详细为您解释这一点：

1. 灵活就业人员社保与公司社保的独立性：

   • 灵活就业人员缴纳的社保，通常包括养老保险和医疗保险，这是基于个人身份缴纳的，与公司缴纳的社保是独立的两个体系。
   • 公司为员工缴纳的社保，包括五险一金（养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险和住房公积金），这是基于劳动关系和公司法定义务进行的。

2. 缴费记录与权益：

   • 灵活就业人员缴纳的社保，其缴费记录和个人权益是记录在个人名下的，与公司无关。
   • 公司为员工缴纳的社保，其缴费记录和权益是记录在公司和员工共同名下的，用于保障员工在劳动关系存续期间的各项权益。

3. 后期对公司缴费的影响：

   • 灵活就业人员之前以个人身份缴纳的社保，不会对公司后续为其缴纳社保产生任何影响。公司仍然需要按照法律规定，为员工缴纳五险一金。
   • 员工的社保缴费记录和个人权益，不会因为之前以灵活就业人员身份缴纳过社保而受到影响或限制。

4. 特殊情况说明：

   • 在某些特殊情况下，如员工之前以灵活就业人员身份缴纳的社保与公司在同一地区，且缴费时间有重叠，可能需要办理社保合并或转移手续。但这并不影响公司后续的缴费义务和员工的社保权益。

综上所述，灵活就业人员社保缴费完，后期对公司缴费一般没有影响。如果您还有其他关于社保或劳动法方面的问题，欢迎随时向我咨询。