母子不在同一户口本上，一般情况下并不会直接产生法律上的不利影响或关系，但可能会在实际生活中带来一些不便，具体取决于具体情境和需求。以下是对这一问题的详细解答：

一、法律层面

从法律上讲，母子关系并不依赖于户口本的共同登记来确立。户口本主要是用于户籍管理和记录家庭成员的基本信息，而母子关系是基于血缘和法律规定的。因此，即使母子不在同一户口本上，也不会影响他们之间的法律关系。

二、实际生活影响

1. 社会保障和福利：在某些情况下，如申请低保、住房补贴等社会保障时，可能会要求提供家庭成员的信息。如果母子不在同一户口本上，可能需要提供额外的证明材料来证明他们的关系，以便相关部门进行审核。

2. 教育：对于孩子的教育问题，如入学、升学等，有些学校或教育机构可能会要求提供家庭户口本作为证明。如果母子不在同一户口本上，可能需要提供其他证明材料，如出生证明、亲子鉴定等。

3. 医疗：在医疗方面，如果母子需要共同享受某些医疗福利或保险，可能会要求提供家庭关系证明。此时，不在同一户口本上可能会带来一些不便。

4. 日常办事：在一些需要证明家庭关系的场合，如办理继承、赠与等手续时，如果母子不在同一户口本上，可能需要提供额外的证明材料来证实他们的关系。

三、解决方案

对于因母子不在同一户口本上而可能带来的不便，可以采取以下措施来解决：

1. 提供额外证明：根据需要，可以提供出生证明、亲子鉴定、法院判决书等法律文件来证明母子关系。

2. 咨询相关部门：在办理具体事务前，可以先咨询相关部门或机构的要求和流程，了解需要提供哪些证明材料和手续。

3. 办理户口迁移：如果条件允许且有必要，可以考虑将母子的户口迁移到同一户口本上，以便更方便地办理相关事务。但需要注意的是，户口迁移可能涉及到一些复杂的程序和条件，需要仔细了解和准备。

综上所述，母子不在同一户口本上并不会直接产生法律上的不利影响或关系，但可能会在实际生活中带来一些不便。为了更方便地办理相关事务和享受相关福利，可以根据具体情况采取相应的解决方案。