检察院不起诉被告不能反诉。在刑事诉讼中，检察院是公诉机关，负责代表国家提起公诉，而被告则是被指控犯罪的一方。反诉通常是指在民事诉讼中，一方当事人在已经开始的诉讼程序中，向本诉的原告提出的一个独立的反请求，目的是抵消或吞并本诉的诉讼请求。

首先，我们要明确的是，检察院在刑事诉讼中并不具备“反诉”的职能。检察院的职责是审查案件证据，决定是否提起公诉，以及在法庭上支持公诉。如果检察院认为案件证据不足或者不符合起诉条件，可以作出不起诉决定。

其次，对于检察院的不起诉决定，被告人是不能直接“反诉”的。如果被告人认为检察院的不起诉决定有误，可以通过其他法律途径进行申诉或者申请复议。但这不是“反诉”，而是对检察院决定的异议。

最后，需要指出的是，刑事诉讼和民事诉讼在程序上有很大的不同。在刑事诉讼中，检察院是公诉机关，而不是当事人，因此不存在“反诉”的概念。而在民事诉讼中，当事人之间可以相互提出诉讼请求和反请求。

综上所述，检察院不起诉被告时，被告不能反诉。如果被告人对检察院的不起诉决定有异议，应该通过合法的法律途径进行申诉或者申请复议。