港澳通行证签注自助办理不一定需要在本地进行。根据国家移民管理局发布的相关政策，自2023年5月15日起，内地居民赴港澳团队旅游签注已经实行“全国通办”。这意味着，内地居民可以向全国任一公安机关出入境管理机构提交赴香港、澳门团队旅游签注申请，申办手续与户籍地一致。因此，您不必一定要回到户籍地办理港澳通行证签注，而是可以选择在就近的出入境管理机构进行办理。

此外，对于申办赴港澳地区探亲、工作、学习等其他类型的证件，也同样实行“全国通办”。内地居民因这些事由拟前往港澳地区的，可以向全国任一公安机关出入境管理机构提交相应的探亲、逗留和其他三类签注申请。

在办理过程中，您可能需要通过一些指定的平台或APP进行预约，如“穗好办”APP就提供了省外户籍人员办理港澳通行证预约服务。预约成功后，您可以按照短信指引，带齐所需资料按时到预约的大厅进行办理。

总的来说，港澳通行证签注自助办理已经实现了全国范围内的通办，为内地居民提供了更加便捷、高效的办证服务。