离婚时有两个孩子的抚养权判决是一个复杂且细致的过程，法院会综合考虑多种因素以确保判决结果最有利于孩子的成长。以下是对这一问题的详细解答：
一、抚养权判决的基本原则
哺乳期子女随母原则：对于不满两周岁的子女，一般随母亲生活，除非母亲有严重疾病、不尽抚养义务等法定情形。
综合考虑原则：两周岁以上的子女，若父母双方均要求抚养，法院会综合考量双方的抚养能力和条件，如经济状况、生活环境、陪伴时间、教育背景等，以最有利于孩子成长为原则进行判决。
尊重孩子意愿：对于已满八周岁的子女，法院会尊重其真实意愿，在判决时予以考虑。
轮流抚养可能性：如果双方条件相当，且均有利于孩子成长，法院可能会考虑采取轮流抚养的方式。
二、影响抚养权判决的具体因素
经济能力：法院会评估双方的经济状况，看哪一方能为孩子提供更稳定、更优越的物质生活条件。
生活环境：包括居住环境、社区环境、学校环境等，法院会考虑哪一方能为孩子提供更稳定、更有利于成长的生活环境。
陪伴时间：法院会考虑双方过去陪伴孩子的时间，以及未来能够给予孩子的陪伴和关爱。
特殊情形：如一方已做绝育手术、子女随其生活时间较长、无其他子女而另一方有其他子女等情形，法院在判决时会予以优先考虑。
不良行为：若一方存在家暴、吸毒等不利于孩子成长的情形，其获得抚养权的可能性会大大降低。
三、抚养费的给付
给付标准：依据《民法典》及相关司法解释，抚养费的给付标准会根据子女的实际需要、父母双方的负担能力和当地的实际生活水平来确定。有固定收入的，一般按其月总收入的百分之五十以内给付；无固定收入的，参照当年总收入或同行业平均收入，按上述比例确定。
给付方式：抚养费可以定期给付，有条件的也可以一次性给付。父母双方也可以协商确定抚养费的数额和给付方式，协议不成则由法院判决。
四、建议与注意事项
协商优先：在离婚过程中，双方应首先尝试通过协商来确定孩子的抚养权归属和抚养费的给付问题，以达成对双方和孩子都最有利的协议。
寻求专业帮助：如果协商不成，可以寻求律师或专业调解机构的帮助，以更专业、更公正的方式解决抚养权问题。
关注孩子感受：在整个过程中，应时刻关注孩子的感受和需求，确保他们的权益得到最大程度的保护。
综上所述，离婚时有两个孩子的抚养权判决是一个综合考虑多种因素的复杂过程。法院会以确保孩子成长为原则进行判决，同时双方也应通过协商或寻求专业帮助来达成最有利于孩子的协议。