关于您提出的“甲方车挂靠在物流公司，转租给乙方怎么办”的问题，这里涉及的是车辆挂靠与转租的法律关系及处理方式。首先，我们明确一点：车辆挂靠与转租需要遵循相关法律法规，并确保各方权益得到妥善保护。

1. 明确法律关系：

   • 车辆挂靠：甲方将车辆挂靠在物流公司名下，通常是为了满足运营资质、管理或税收等方面的需求。这种挂靠关系应通过书面合同明确，包括挂靠期限、费用、双方权利义务等。
   • 转租关系：甲方将挂靠的车辆转租给乙方，这同样需要签订转租合同，明确转租期限、租金、车辆使用、维修、保险及事故处理等条款。

2. 确保合同有效性：

   • 无论是挂靠合同还是转租合同，都应确保其内容合法、有效，不违反国家法律法规的强制性规定。
   • 合同双方应具有相应的民事行为能力，且合同应体现双方的真实意愿。

3. 遵守税务规定：

   • 车辆挂靠和转租可能涉及税收问题，如增值税、所得税等。双方应了解并遵守相关税务规定，确保合法纳税。

4. 处理可能的法律风险：

   • 在挂靠和转租过程中，可能会出现车辆损坏、交通事故、违约等风险。双方应在合同中明确风险承担方式，并考虑购买相应的保险以转移风险。

5. 争议解决：

   • 合同中应约定争议解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。一旦发生争议，双方应按照约定方式解决。

综上所述，甲方车挂靠在物流公司并转租给乙方时，应确保各方法律关系明确、合同有效、税务合规，并妥善处理可能的法律风险。如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。