毕业生与用人单位发生劳动争议时，可以按照以下步骤处理：

一、协商

首先，双方应依据平等自愿、合法合理的原则，针对争议事项进行沟通协商，努力达成一致解决方案。例如，如果争议涉及工作岗位调整、薪资待遇等问题，毕业生与用人单位可以坐下来，心平气和地交流各自的想法，寻求双方都能接受的处理办法。

二、调解

如果协商无果，毕业生可以向企业劳动争议调解委员会或依法设立的基层人民调解组织申请调解。这些调解组织会依据自愿、合法的原则开展调解工作，努力促使双方达成调解协议。在调解过程中，调解人员会详细了解双方的争议焦点，居中协调，提出合理建议，推动双方互相理解，达成共识。

三、仲裁

如果调解不成或毕业生不愿继续调解，可以在规定时效内向劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请。仲裁委受理后，会安排开庭审理并作出裁决。在申请仲裁前，毕业生需要整理好相关证据材料，如劳动合同、工资条、工作证等，以便在仲裁过程中证明自己的主张。

四、诉讼

如果毕业生对仲裁裁决不服，除部分一裁终局的案件外，可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，法院将依法审理并判决。需要注意的是，整个过程中务必留存好各类相关证据，以维护自身的合法权益。

法律依据：

根据《劳动争议调解仲裁法》第五条，发生劳动争议时，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。

综上所述，毕业生在与用人单位发生劳动争议时，应首先尝试通过协商和调解解决；如果无法达成一致，可以依法申请仲裁和提起诉讼。在整个过程中，保留好相关证据是维护自身权益的关键。