加班工资按底薪算是否合法，需视具体情况而定，但通常情况下，仅按底薪计算加班工资是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：
一、合法情况（较为少见）
劳动合同或集体合同有明确且合理的约定：
- 如果劳动合同或集体合同中明确约定了加班工资的计算基数，且该基数不低于当地最低工资标准，同时是双方真实意思的表示，那么按照合同约定的方式计算加班费是合法的。但这种情况较为少见，因为底薪通常只是劳动者工资的一部分，不包括奖金、津贴等，若仅以底薪为基数，往往难以保障劳动者的合法权益。
用人单位制度规定且员工同意，且基数合理：
- 用人单位依法制定的工资支付制度中明确规定了加班工资的计算基数，该基数包含了劳动者的基本工资、奖金、津贴等，且已经通过民主程序制定并向员工公示，员工在知晓且未提出异议的情况下，该制度也可作为计算加班费的依据。但同样，若基数仅为底薪，则很可能不符合法律规定。
二、不合法情况（较为常见）
低于法定标准：
- 根据我国《劳动法》第四十四条的规定，加班费的计算基数不得低于劳动者正常工作时间的工资，且具体支付标准需按照工作时间延长的不同情况（工作日、休息日、法定节假日）分别支付不低于工资的150%、200%、300%的工资报酬。如果计算基数低于当地最低工资标准或劳动合同约定的工资标准（通常应包含底薪、奖金、津贴等），则是不合法的。
未遵循约定或规定，擅自按底薪计算：
- 当劳动合同和集体合同都没有对加班费的计算基数作出约定，且用人单位没有制定相关工资支付制度，或者制定的制度未经民主程序制定、未向员工公示，或者员工提出异议时，用人单位应按照劳动者正常工作时间的工资作为计算加班费的基数。如果用人单位擅自按照较低的标准（如仅按底薪）计算加班费，则构成违法。
三、加班工资的合理计算方式
- 确定计算基数：加班费的计算基数应为劳动者的应得工资，包括基本工资、绩效奖金、津贴、补贴等各项收入。具体计算时，可根据劳动合同或集体合同中的约定来确定，或者按照劳动者的实际工资来确定。
- 按照法定倍数计算：
- 工作日加班：小时加班工资标准 = 劳动合同规定的月工资标准 ÷（月计薪天数21.75×8小时）× 150%。
- 休息日加班：小时加班工资标准 = 劳动合同规定的月工资标准 ÷（月计薪天数21.75×8小时）× 200%。
- 法定休假日加班：小时加班工资标准 = 劳动合同规定的月工资标准 ÷（月计薪天数21.75×8小时）× 300%。
四、维权途径
如果用人单位存在违法计算加班费的情况，你可以通过以下途径维护自己的权益：
- 与用人单位协商解决：首先尝试与用人单位沟通，要求按照法律规定支付加班费。
- 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
- 申请劳动仲裁：在必要时，你可向劳动仲裁机构申请仲裁，要求用人单位支付拖欠的加班工资及相应赔偿。
总结与建议：加班工资的计算应遵循法律规定，确保劳动者的合法权益得到保障。如果用人单位仅按底薪计算加班工资，很可能构成违法。建议你先查看自己的劳动合同或集体合同中是否有关于加班工资计算基数的约定，如果没有约定或约定不明确，可与用人单位协商或向相关部门投诉。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。