结论前置：自离时公司扣一半工资的行为，通常是不合法的。员工有权获得其实际工作期间的工资，若因自离给单位造成经济损失，单位可依法要求赔偿，但赔偿金额需合理，且扣除工资有严格限制。
一、法律依据与基本原则
工资支付规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，无论员工是正常离职还是自离，公司都应支付其实际工作期间的工资。
劳动合同解除规定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日（或在试用期内提前三日）以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。若劳动者未按规定提前通知而自离，即构成违法解除劳动合同，但公司不能因此随意克扣工资。
二、自离时工资的支付与扣除
已提供劳动部分的工资支付：
- 劳动者自离前已经实际提供了劳动的，公司应当按照双方约定或公司规定的工资计算方式，支付相应的劳动报酬。例如，员工在本月工作了若干天后自离，公司应支付其实际工作天数的工资。
因自离给单位造成损失的赔偿：
- 若劳动者的自离行为给公司造成了经济损失，公司可以要求劳动者进行赔偿。但赔偿金额的计算应合理，且每月从工资中扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 计算公式（若需赔偿且从工资中扣除）：
- 每月最多扣除金额 = 当月工资 × 20%
- 扣除后实发工资 = 当月工资 - 每月最多扣除金额（若扣除后低于最低工资标准，则按最低工资标准支付）
特殊情况：
- 如果劳动者与公司签订了竞业限制协议或服务期协议，并且自离行为构成违约，劳动者需要按照协议约定向公司支付违约金。但违约金的数额应当合理，且扣除方式需符合法律规定。
三、维权措施
与公司协商：
- 尝试与公司人力资源部门或上级领导友好沟通，了解扣工资的具体原因，并要求公司提供明确的依据。明确指出公司扣工资行为不合法，要求纠正并补发工资。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉。投诉时需准备身份证、劳动关系证明（如劳动合同、工作证）、克扣工资证据等材料。劳动监察部门将对公司进行调查处理，并可能责令公司改正违法行为，足额支付工资。
申请劳动仲裁：
- 若投诉未能解决问题，可以在劳动争议发生之日起一年内向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。提交仲裁申请书及相关证据材料，参与开庭审理，等待仲裁委的裁决。
提起诉讼：
- 如果对仲裁结果不服，可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。法院将依法审理案件，并作出最终判决，保障劳动者的合法权益。
四、注意事项与建议
- 保留证据：在整个维权过程中，务必保留好各类证据，包括但不限于劳动合同、工资条、考勤记录、工作证、与公司沟通的聊天记录、邮件等。这些证据在协商、投诉、仲裁过程中起到关键作用，有助于证明你的权益。
- 合理维权：在维权时，要保持冷静和理性，避免采取过激行为。通过合法途径维护自己的权益，是更加有效和可持续的方式。
- 及时咨询：如果你对自离扣工资的问题感到困惑或不确定如何处理，可以随时向我咨询。我会根据你的具体情况，提供更加详细和个性化的法律建议。
综上所述，自离时公司扣一半工资的行为通常是不合法的。员工应首先尝试与公司协商解决，若协商无果，可通过向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。